保證毛細管電泳儀有效分離的關鍵，使實驗重復性達到應用要求
毛細管電泳儀采用并行毛細管電泳（CE）與熒光檢測技術相結合，能夠對DNA和RNA電泳分離檢測。毛細管列陣是并行毛細管電泳的基礎，根據毛細管列陣的毛細管數量分為96和12通道，每個毛細管首先注入可導電的分離膠，然后對毛細管兩端施加電場，96孔板中的預檢測樣品開始毛細管電泳。依據核酸片段長度不同在凝膠電泳中遷移速度不同的原理核酸樣品被分離檢測。當毛細管中核酸片段通過位于LED和CCD探測器組件之間的檢測窗口時被實時檢測。核酸檢測組件是由一個LED光源（470納米激發）、照相機鏡頭和CCD探測器組成的光學平臺。LED光源（470納米激發）激發核酸樣品中的嵌入染料產生熒光信號，然后通過相機鏡頭和特定的濾光器立體成像到CCD檢測器，把實時熒光信號轉換為實時電信號被軟件實時讀取，由此測繪每個樣品完整的核酸片段分布峰圖。
毛細管電泳是一種在空芯的、極微小內徑的毛細管中進行的液-液相大、小分子的蛋白分離技術。
毛細管兩端分別浸入緩沖液中，而緩沖液中分別插入連有高壓電源的電極，根據被分離物之間電荷和體積的不同，帶電荷分子朝相反極性的電極方向移動。又利用毛細管內壁上的電荷和應用的勢能而引起的電解質移動，毛細管內表面帶有硅羥基基團，當毛細管內充滿緩沖溶液時，毛細管壁上的硅羥基發生解離，生成氫離子溶解在溶液中，這樣就使毛細管壁上形成雙電層，管壁是負電荷層，溶液是正電荷層。
在毛細管的兩端加上直流電場后，帶正電的溶液就會整體向負移動，形成了電滲流。無論是帶正電、帶負電或不帶電的粒子，都在電滲流的作用下，向陰極遷移，帶正電的，受到同方向的電場力作用，遷移快，不帶電的遷移速度次之，帶負電的遷移速度慢，(因為它受到與電滲流反方向的電場力作用)，從而實現各蛋白組分的分離。
毛細管電泳儀的優勢
1、毛細管電泳儀的自動進樣系統*實現全自動原始管上樣，操作人員只需將帶有條形碼的原始管放在儀器試管架上，初始操作完畢后即可離開，毛細管電泳儀將自動連續運行樣品，無須人為干預。樣本經儀器自動稀釋后，由高精氣壓控制的納升級樣品進樣系統將樣品地吸入毛細管內部。
2、樣品溫控系統該高速電泳分離系統整合了一個高精度Peltier自動溫控裝置，能夠對毛細管中產生的焦耳熱進行實時穩定的控制，是保證毛細管電泳儀有效分離的關鍵，使實驗重復性達到應用要求。
3、毛細管電泳儀可以進行多種臨床項目的檢測。
4、毛細管電泳儀檢測結果*數據化、信息化管理利用互聯網技術，實現各項檢測結果的傳輸，包括曲線，工作流程和結果報告，并可建立實驗室內部網絡資庫。
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